Přehled článků 2010

Školitel: Doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.

Abstrakt

Astrogliální tumory jsou skupinou nádorů derivující se z buněk astrogliální řady. Jsou to jedny z nejčastěji diagnostikovaných tumorů nervového systému. Tato skupina nádorů je v mnoha aspektech různorodá. Nádory se od sebe liší nejen morfologicky, ale také růstovým potenciálem, rozsahem invazivního růstu, svou lokalizací v CNS i klinickým průběhem v důsledku jejich progresivních vlastností. Různorodost těchto novotvarů je dána sekvencí a typem genetických alterací v průběhu procesu nádorové transformace. Podle současné užívané klasifikace můžeme astrogliální nádory rozdělit na benigní formy I.-II. (low grade glioma-I. pilocytární astrocytom, II. difúzní astrocytom) a maligní formy III.-IV. (high grade glioma-III. anaplastický astrocytom, IV. glioblastom). Pro určení, zdali je nádor spíše benigní či maligní povahy je z histologického hlediska rozhodující množství vazoproliferativních a nekrotických změn spolu s počtem buněčných dělení. Z hlediska molekulárně-genetického jsou důležité typy a počty kumulujících se genetických alterací. Jedny z podstatných alterací nastávají v genech p53, PTEN a EGFR.

Klíčová slova: astrocytom, glioblastom, imunohistochemie, molekulárně-biologické metody, mutace, tumorsupresorové geny, amplifikace, gen p53, gen PTEN, amplifikace EGFR faktoru

 celý článek

 English

Školitelka: Doc. Ing. Lenka Lhotská, CSc.

Abstrakt

Využití znalostí ve formě postupů, konkrétně organizačních procesů a formalizovaných lékařských doporučení, může být vhodné pro vytvoření znalostní báze systému pro podporu v rozhodování (DSS) v oblasti poskytování zdravotní péče. Problém nastává v případě, že pro vývoj DSS chceme použít multiagentní přístup z důvodu rozdílů mezi formalizací chováním se agentů a procesním zápisem. V tomto příspěvku pokračujeme v práci na nové multiagentní architektuře a představíme její integraci do stávajícího systému na podporu v rozhodování (K4Care) v oblasti domácí péče.

Základní metodou byla analýza dostupné dokumentace ke komplexnímu systému K4Care, na jejímž základě jsme identifikovali společná místa v rámci již existující funkcionality a návrhu nové architektury. Ta dále posloužila jako výchozí body pro vylepšení modelu K4Care s ohledem na novou multiagentní architekturu založenou na procesech.

Analýza potvrdila nejen možnost takové integrace, ale také její přímočarost a minimum nutných změn v modelu K4Care díky dostatečně obecnému návrhu multiagentní architektury založené na procesech. Na základě integrace byly identifikovány okamžité vylepšení podporující lidského experta při jeho práci se systémem, jakož i možnosti dalšího rozšíření systému K4Care na základě této integrace.

Integrace multiagentní architektury může být přínosná i pro stávající systémy pro podporu v rozhodování a díky ní otevře nové možnosti založené na multiagentním přístupu.

Klíčová slova: multiagentní systémy, multiagentní architektury, organizační procesy, formalizované lékařské doporučení, zdravotní péče, domácí péče K4Care

 celý článek

 English

 Slovensky

Školitelka: Prof. MUDr. Taťjana Dostálová, DrSc., MBA

Abstrakt

V dnešní době moderní pokrok v biomedicíně umožňuje lépe pochopit funkci temporomandibulárního kloubu (TMK) a to pomocí zobrazovacích metod. Zpracování získaných dat pomocí moderních programů vytváří nový pohled na rekonstrukci TMK, dále usnadňuje diagnostickou a terapeutickou fázi. K zobrazení TMK jsou k dispozici různé zobrazovací metody. Mezi ně patří základní rtg snímky (např. ortopantomogram, tomogramy TMK), ultrasonografie, MRI, spirální a 3D-počítačová tomografie. Na základě těchto metod lze snímat požadované úseky čelistního kloubu v různých rovinách a ze získaných dat vytvořit model TMK ve 3D rekonstrukci. To přináší zkvalitnění diagnostického procesu. Cílem naší studie je ukázka využití zobrazovacích metod při sledování pacientky během 1 roku.

V této studii se zabýváme analýzou matematického a počítačového 3D modelu TMK. U pacientky sledujeme léčebný plán krok za krokem od konzervativní terapie, chirurgické terapie TMK, až k procesu hojení. 3D-CT modelace nám umožňuje sledovat jednotlivé fáze léčby u pacientky s radikulární cystou dolní čelisti.

Zpracováním matematického a počítačového modelu TMK do 3D-CT modelu TMK analyzujeme stav kloubu před chirurgickým zákrokem a rok po zavedení subtotální náhrady TMK. Modelace zobrazuje stabilitu subtotální náhrady TMK.

Matematické modelování a matematická simulace náhrady čelisti a/nebo TMK může být využito v plánování zhotovení kloubní náhrady. Tato studie prokazuje praktické využití 3D-CT snímků při terapii TMK. Další aplikace matematického modelování čelisti může být využito k zobrazení změn po ortognátní operaci, k hodnocení vlivu okluzních dlah na zatížení TMK, stejně jako k hodnocení u nádorových stavů a cyst. Ačkoliv mnoho z poruch čelistního kloubu a souvisejících struktur může být diagnostikováno klinicky na základě anamnézy a fyzikálního vyšetření, je mnoho poruch TMK, které můžeme diagnostikovat jen na základě zobrazovací techniky pro přesnou diagnózu a určení rozsahu postižení. Zobrazení tvrdých a měkkých tkání čelistního kloubu může být použito nejen pro léčbu, plánování, ale také pro hodnocení dlouhodobé léčby.

Klíčová slova: stomatologie, maxilofaciální chirurgie, subtotální náhrada TMK, 3D-CT, magnetická rezonance, temporomandibulární kloub

 celý článek

 English

Školitel: Doc. Zdeněk Valenta, M.Sc., M.S., PhD.

Abstrakt

Analýza přežití je soubor statistických metod, ve kterých je zkoumána doba do výskytu sledované události. V biomedicínských aplikacích takovou událostí může být např. výskyt primárního onemocnění nebo úmrtí pacienta. Charakteristickým jevem v analýze přežití je tzv. cenzorování a krácení dat, kdy pracujeme pouze s částečnou informací o přežití pacientů (např. sledování pacientů typicky skončí dřív, než všichni zemřou). Metody analýzy přežití slouží k odhadu rozdělení doby do výskytu sledované události resp. přežití pacienta, k určení rizikových faktorů, které ovlivňují délku přežití, a také k predikci času přežití v závislosti na přítomnosti rizikových faktorů. K rozvoji metod analýzy přežití přispívá také využití teorie čítacích procesů a martingalů. Jednorozměrné metody analýzy přežití nelze použít, jestliže není splněn předpoklad nezávislosti jednotlivých dob přežití. V takovém případě je nutné využít vícerozměrné metody, jako jsou např. vícestavové modely nebo modely náchylnosti.

Klíčová slova: analýza přežití, funkce přežití, riziková funkce, kumulativní riziková funkce, cenzorování, krácení, Kaplanova-Meierova funkce přežití, Nelsonova-Aalenova funkce rizika, Coxův model proporcionálních rizik, metoda parciální věrohodnosti, čítací proces, historie, filtrace, martingal, konkurující rizika, vícestavové modely, modely náchylnosti

 celý článek

 English

Školitelka: Prof. MUDr. Taťjana Dostálová, DrSc., MBA

Abstrakt

Naše experimentální práce se věnuje tvorbě nového typu elektronické zdravotnické dokumentace (EHR) pro oblast stomatologie, obzvláště pro poruchy temporomandibulárního kloubu (TMD) a hlavním cílem je vytvoření komplexního systému, který by byl dobrým základem pro podporu rozhodování v terapii TMD.

Náš EHR systém je založen na Stomatologické znalostní bázi, která je vytvořená v aplikaci MUDR (Multimedia distribuující EHR) a potom také v MUDRLite aplikaci. Architektura MUDRLite je postavena na dvou vrstvách (relační databáze (např. MS SQL server) a uživatelské vrstvě (MUDRLite UI), která je popsána v XML konfigurační složce). Tyto aplikace tvoří reálnou grafickou uživatelskou aplikaci DentCross, která je propojena s ASR (Automatic speech recognition) systémem a TTS (Text-to-speech) modulem. Speciální TMD EHR je částí DentCross a je vytvořena ve stejných aplikacích. Celá tato část využívá klasifikaci RCD/TMD (Research diagnostic kriteria for TMD).

Integrovaný Dental-TMJ EHR systém umožňuje záznam komplexních zdravotnických dat pacienta ve stomatologii. Postihuje celý ortognátní systém s jeho všemi složkami (především TMD problematika) v grafické podobě. Záznam a manipulaci s daty zjednodušuje ASR systém a TTS modul. Tato aplikace byla navržena s důrazem na jednoduchost ovládání a schopnost zaznamenat úplnou informaci a měla by pomoci při rozhodování o terapii TMD.

Náš Integrated Dental-TMJ systém reprezentuje celou stomatologickou informaci pacienta, která je podstatná pro tvorbu léčebného plánu. Spojení s ASR systémem a TTS modulem zjednodušuje sběr těchto informací. Informace jsou také přehledně uspořádané v grafické formě. Dalším krokem bude pokračování v klinickém testování celého systému a vylepšení ASR systému a TTS modulu. Nevýhodou systému může být nutná zkušenost s ovládáním této aplikace a fungování ASR systému ve velmi hlučném prostředí.

Klíčová slova: elektronická zdravotnická dokumentace, automatické rozpoznávání řeči, zubní kříž, temporomandibulární kloub, poruchy temporomandibulárního kloubu, strukturovaný záznam dat, stomatologie, datový model, text-to-speech modul, Research Diagnostic Criteria for TMD

 celý článek

 English

Školitel: Doc. MUDr. Ing. Daniel Smutek, Ph.D.

Abstrakt

Cílem práce bylo porovnání úspěšnosti texturního klasifikátoru a vyšetřujícího lékaře (radiologa) při diagnóze autoimunitní thyroiditidy ze sonografického obrazu snímaného v B-módu. Určení inter- a intrapersonální variability lékařů.

Datový soubor obsahující 161 vyšetřovaných subjektů byl rozdělen do tří skupin dle celkového klinického vyšetření: normální – H (healthy); hraniční stav – BS (border state); autoimunitní thyroiditida – AT. Následně byl soubor čtyřmi vyšetřujícími lékaři a Bayesovským klasifikátorem, založeným na texturních příznacích, hodnocen do těchto skupin.

Dva lékaři dosáhli vyšší úspěšnosti při hodnocení subjektů z normální skupiny (74,4 % a 83,3 %) a dva lékaři hodnotili lépe subjekty s autoimunitní thyroiditidou (59,0% a 77,4 %). Klasifikátor dosáhl relativně vysoké a vyrovnané úspěšnosti pro obě tyto skupiny (100,0 % pro normální a 87,5 % pro thyroiditidu). Rozdílný úspěch jednotlivých lékařů při hodnocení subjektů vyústil ve vyšší interpersonální variabilitu, tedy nízkou shodu mezi nimi. V intrapersonální variabilitě jednotlivých lékařů nebyl nalezen významný rozdíl.

Vzhledem ke slabé shodě mezi vyšetřujícími lékaři při diagnostice autoimunitní thyroiditidy ze sonografických obrazů a vysoké a vyrovnané úspěšnosti klasifikátoru se zdá jako nejvýhodnější pro stanovení konečné diagnózy kombinace automatické klasifikace obrazů a klinických zkušeností lékařů.

Klíčová slova: štítná žláza, autoimunitní thyroiditida, sonografický obraz, B-mode sonografie, texturní analýza, počítačem podporovaná diagnóza, interpersonální variabilita, intrapersonální variabilita, koeficient Kappa, vážený koeficient Kappa

 celý článek

 English

Školitelka: Prof. RNDr. Jana Zvárová, DrSc.

Abstrakt

Cílem práce bylo zkoumat vztah mezi zobecněnou entropií diskrétní náhodné veličiny (tzv. f-entropií, třídou funkcí, zahrnující řadu indexů používaných pří měření biodiverzity) a minimální Bayesovskou pravděpodobností chyby při odhadu hodnoty této náhodné veličiny. Zejména studovat těsnost jejich vztahu.

Morales a Vajda [1] nedávno zavedli míru zvanou průměrná nepřesnost (average inaccuracy), která kvantifikuje těsnost vztahu mezi aposteriorní Bayesovskou pravděpodobností chyby a mocninnými entropiemi. Tato míra je definována jako normalizovaný průměrný rozdíl horní a dolní meze aposteriorní Bayesovské pravděpodobnosti chyby za dané entropie. Tuto míru je možno zobecnit na jakoukoli striktně konkávní f-entropii a použít ji k vyjádření těsnosti vztahu této f-entropie k aposteriorní Bayesovské pravděpodobnosti chyby. Získaný vztah je však většinou poměrně složitý a není možné snadno analyticky porovnat průměrné nepřesnosti různých f-entropií.

Navrhujeme hladkou aproximaci dolní meze aposteriorní Bayesovské pravděpodobnosti chyby za dané f-entropie, jejíž použití zjednoduší formuli průměrné nepřesnosti. Ukázali jsme, že při použití této aproximace má kvadratická entropie nejtěsnější vztah k aposteriorní Bayesovské pravděpodobnosti chyby mezi f-entropiemi.

Kvadratická entropie má těsnější vztah k Bayesovské pravděpodobnosti chyby (ve smyslu popsaném v článku) než Shannonova entropie a další funkce příslušící do třídy f-entropií, jako např. Emlenův index, Ferreriho index, Goodův index a další.

Klíčová slova: zobecněná entropie, f-entropie, Bayesovská pravděpodobnost chyby, průměrná nepřesnost, mocninná entropie, kvadratická entropie, Shannonova entropie, Emlenův index, Ferreriho index, Goodův index

 celý článek

 English

Školitelka: Prof. RNDr. Jana Zvárová, DrSc.

Abstrakt

Hodnocení velikosti plodu pomocí ultrazvukové biometrie je stěžejní pro správný management těhotenství. K interpretaci těchto měření nám slouží referenční intervaly a kvantilové křivky závislé na gestačním stáří. Pomocí nich identifikujeme extrémní hodnoty, které mohou poukázat na přítomnost patologie. Nejprve jsou zmíněny základní body důležité pro vlastní návrh studií používaných pro konstrukci těchto intervalů. Hlavním cílem práce je podat přehled dostupných statistických metod pro tvorbu referenčních intervalů a kvantilových křivek, jejich metodik, hodnocení shody modelu s daty, jejich výhod a omezení.

Klíčová slova: plod, gestační stáří, ultrazvuk, biometrie, patologie, referenční interval, kvantil, kvantilová křivka, normální rozdělení, normalizující transformace, kvantilová regrese

 celý článek

 English

Školitel: Ing. Milan Šárek, CSc.

Abstrakt

Infrastruktura jako služba, tedy infrastruktura poskytovaná zákazníkovi formou služby poskytovatele, je jedním z modelu nasazení tzv. cloud computingu, který umožňuje využít datovou a výpočetní kapacitu v cloudu jako množinu fyzických či virtuálních zařízení. Infrastruktura jako služba může být poskytována zvlášť každému výzkumnému projektu a přitom sdílet stejné fyzické kapacity zapojených počítačů a zařízení. V současné době je testováno poskytování infrastruktury jako služby několika projektům v rámci aktivit sdružení CESNET, 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy v Praze (1. LF UK) a Hudební a taneční fakulty Akademie múzických umění v Praze (HAMU).

Současný výzkum v oblasti výpočetní fyziologie je náročný na výpočetní kapacitu. Výpočetní úlohy jsou distribuovány počítačům, které jsou poskytovány infrastrukturou. Projekt v oblasti analýzy lidského hlasu je náročný na propustnost počítačové sítě mezi akustickým a video zařízením na lokální straně a analytickou aplikací na straně výkonného serveru. Tento příspěvek popisuje hlavní vlastnosti a výzvy pro infrastruktury určené pro takovýto typ aplikací. Infrastruktura jako model nasazení v rámci cloud computingu může být vhodná pro mezioborové týmy a pro spolupráci a integraci vysoce specializovaných softwarových aplikací.

Klíčová slova: cloud computing, infrastruktura jako služba, virtualizace, výpočetní fyziologie, identifikace fyziologických systémů, validace fyziologických systémů, protokol vzdálené plochy, grid computing, hlasové pole

 celý článek

 English

Školitelka: Prof. RNDr. Jana Zvárová, DrSc.

Abstrakt

Cílem příspěvku je porovnat české lékařské zprávy psané volným textem a pomocí softwarové aplikace; analyzovat využitelnost mezinárodních klasifikačních systému v českém zdravotnickém prostředí. Analýza lékařských zpráv byla založena na atributech Minimálního datového modelu pro kardiologii (MDMK). Použili jsme lékařské zprávy psané volným textem a lékařské zprávy ze softwarové aplikace ADAMEK, kde jsou data ukládána strukturovaně. Pro naši práci jsme využili SNOMED CT a MKN-10. Zaměřili jsme se na jazyk česky psaných lékařských zpráv a na aplikaci výše zmíněných mezinárodních klasifikačních systémů v MDMK. Porovnali jsme, jak dobře jsou atributy MDMK zaznamenány v textových lékařských zprávách a v lékařských zprávách zaznamenávaných strukturovaně pomocí softwarové aplikace ADAMEK. Provedli jsme jazykovou analýzu českých textových lékařských zpráv. Dospěli jsme tedy k závěru, že zapisování lékařských zpráv formou volného textu je velice nehomogenní a není standardizováno. Standardizovaná terminologie by přinesla výhody lékařům, pacientům, administrátorům, softwarovým vývojářů a plátcům. Pomohla by poskytovatelům zdravotnické péče tím, že by poskytovala kompletní a snadno dostupné informace, které náleží k procesu zdravotnictví a to by vyústilo v lepší péči a pacienty. Použití mezinárodních klasifikačních systémů je nezbytným prvním krokem, který umožní interoperabilitu heterogenních elektronických zdravotních záznamů.

Klíčová slova: terminologie, synonyma, klasifikační systémy, tezaurus, nomenklatura, elektronický zdravotní záznam, interoperabilita, sémantická interoperabilita, kardiologie, ateroskleróza

 celý článek

 English

Školitel: Doc. Ing. Vojtěch Svátek, Dr.

Abstrakt

Moderní technologie poskytují řadu možností jak publikovat na internetu téměř cokoli, co autor zamýšlí. To se týká i medicínských informací, kde se široká dostupnost mnoha informací s takto závažným obsahem ve velmi variabilní kvalitě, stává velkým problémem. Bohužel v současné době jediná reálná možnost, jak ověřit kvalitu medicínských textů, je verifikace odborníkem v oboru. Doporučené postupy (DP) v lékařství jsou systematicky vytvářeny a publikovány renomovanými lékařskými společnostmi na základě výsledků medicíny založené na důkazech (MZD).

Cílem této práce je předložit jednoduchý postup posouzení webových stránek (WS) s využitím řízených medicínských slovníků a DP, jakožto standardu pro hodnocení kvality obsahu. Postup je založen na myšlence, že sdělení dokumentu nebo přinejmenším jeho informační rozsah je reflektován použitými odbornými výrazy v textu. Diskutujeme možné využití tohoto přístupu v procesu poloautomatického hodnocení kvality včetně dalších souvislostí jeho aplikace.

Podstatou přístupu je vyhledání kandidátů na koncepty v DP a v testovaných WS prostřednictvím mapování na UMLS. Tím jsou získány seznamy obsažených termínů a jim odpovídajících konceptů. Pro DP byly navrženy a vyhodnoceny nejvhodnější agregace, proti nimž byla následně analyzována podobnost testovaných WS na úrovni termínů a konceptů.

Metoda byla aplikována na vybranou medicínskou oblast s využitím tří relevantních DP a 100 WS. Analyzované WS spadaly do pěti odlišitelných kategorií (s ohledem na jejich cílovou skupinu). Byly navrženy a vyhodnoceny agregace termínů pro DP. Průměrná kosinová podobnost všech WS k DP dosáhla 0,69, přičemž podobnostní průměry za kategorie WS variovaly v rozmezí 7,6 % oproti celkovému průměru.

Dosavadní výsledky jsou prvním krokem směrem k automatickému hodnocení medicínských webových zdrojů s využitím DP jakožto standardu kvality. Diskutujeme další plánované úlohy, mířené k vylepšení výstupů porovnání a jejich obecnosti.

Klíčová slova: hodnocení informační kvality, řízené medicínské slovníky, UMLS, medicína založená na důkazech (MZD), lékařské doporučené postupy (DP), informační kvalita, anotace, podobnost, koncept, reprezentace obsahu

 celý článek

 English

Školitel: Doc. RNDr. Petr Lánský, CSc.

Abstrakt

Jednou z důležitých úloh při zkoumání struktury sledu akčních potenciálů je odhad tzv. firing rate funkce. Cílem článku je popsat možné zrychlení algoritmu, který může být pro tento odhad použit.

Protože neexistuje jednoznačná metoda, kterak firing rate funkci odvodit, bylo navržené celé spektrum odlišných strategií. Jedna z populárních metod odhadu je konvoluce sledu akčních potenciálů gaussovským jádrem s patřičnou šířkou. Výběr konkrétního jádra a šířky je obvykle diskutabilní a autoři v nedávném článku [1] navrhují přesný algoritmus pro výpočet optimální šířky pro (nejen) gaussovská jádra. Pro rozsáhlejší množinu vstupních dat je elementární verze algoritmu bohužel neefektivní z hlediska času potřebného pro výpočet.

V příspěvku navrhujeme vylepšenou implementaci algoritmu, která je efektivní i pro velká množství vstupních dat.

Na konkrétních výsledcích implementovaného algoritmu bylo demonstrováno dosažené zrychlení, což potvrzuje vhodnost navrhované metody.

Klíčová slova: akční potenciál, sled akčních potenciálů, neurální kódování, firing rate, konvoluce, gaussovské jádro, šířka jádra, Brentova minimalizace, paralelní výpočet, MPI

 celý článek

 English

Školitel: Prof. MUDr. Štěpán Svačina, DrSc.

Abstrakt

Onemocnění štítné žlázy jsou u těhotných žen časté. V České republice není zaveden plošný screening na toto onemocnění. Cílem práce bylo zhodnotit náklady pilotní studie screeningu onemocnění štítné žlázy u těhotných žen.

Použili jsme jednoduché statistické metody pro srovnání nákladů na pilotní screeningovou studii 2651 žen (vyšetřeny parametry TSH a TPOAb) vzhledem ke skutečným současným nákladům dle číselníku výkonů. Provedli jsme analýzu nákladů a přínosů pro pacientky v případě, že se vyšetřuje pouze TSH nebo TPOAb parametr.

Screening pouze TSH parametru je 2,7 krát nákladově efektivnější než TPOAb. Screening pouze TSH může vést k vynechání 77 žen pozitivně testovaných na TPOAb. Screening pouze TPOAb parametru může znamenat vynechání 77 žen pozitivně testovaných na TSH.

K dosažení lepší senzitivity je nutné provádět TSH a TPOAb screening společně, protože oba parametry se vzájemně vhodně doplňují, ačkoliv TSH screening je 2,7 krát levnější.

Klíčová slova: onemocnění štítné žlázy, tyreopatie, těhotenství, nákladová efektivita, screening, iq, qaly

 celý článek

 English

Školitel: Doc. Ing. Vojtěch Svátek, Dr.

Abstrakt

Zdravotnická dokumentace má v České republice obvykle povahu volného textu formátovaného jen pomocí mezer, tabulátorů a nových řádků. Extrakce informací z takových zpráv představuje výzvu, jejíž splnění by umožnilo její snadné využívání při poskytování zdravotní péče v zahraničí či převod do strukturované formy. Pro identifikaci a extrakci informací lze využít různých přístupů, od regulární analýzy po pokročilou lingvistickou analýzu a statistické metody. Článek shrnuje naše poznatky získané při regulární analýze a při využití běžně využívaných klasifikačních systémů.

Klíčová slova: zpracování přirozeného jazyka, zdravotnická dokumentace, elektronický zdravotní záznam, regulární analýza, lingvistická analýza

 celý článek

 English

Školitel: Doc. Ing. Arnošt Veselý, CSc.

Abstrakt

Od devadesátých let minulého století narůstá publikační aktivita odborných autorit při tvorbě dokumentů klinických doporučených postupů (KDP). Během první dekády 21. století v rámci trendu popularity sdílení informací v elektronické podobě se jedním z hlavních publikačních médií těchto dokumentů stává internet. Podle předchozího průzkumu webových sídel českých lékařských odborných společností a zkušeností z dosavadního provozu Katalogu klinických doporučených postupů publikuje v současné době na internetu přibližně 107 českých odborných společností až 731 KDP. Dokumenty klinických doporučených postupů jsou používány lékaři a ostatními klinickými pracovníky v klinické praxi, správními autoritami při posuzování a vyhodnocování konkrétních klinických postupů, tvůrci zdravotních politik, lékaři při vzdělávání, pacienty a v neposlední řadě jsou informace v těchto dokumentech obsažené klíčové pro tvorbu klinických informačních systémů, systémů pro podporu rozhodování a dalších aplikací medicínské informatiky.

Databáze Katalogu klinických doporučených postupů postupně od roku 2007 mapuje výskyt dokumentů KDP v rámci volně přístupných webových sídel českých odborných společností, případně odborných periodik těmito společnostmi garantovaných. V rámci této databáze jsou shromažďovány bibliografické informace, informace o aktuálnosti a kvalitě dokumentů a o existenci případných webových nástrojů a aplikací vytvořených na základě těchto KDP.

Databáze obsahuje 562 záznamů o dokumentech KDP publikovaných českými odbornými společnostmi. 212 záznamů je přístupných prostřednictvím webového rozhraní Katalogu klinických doporučených postupů.

Klíčová slova: internet, World Wide Web, databáze, klinický doporučený postup, klinická praxe, medicína založená na důkazech, formalizace, GLIF (Guideline Interchange Format), lékař, systémy pro podporu rozhodování

 celý článek

 English

Přetištěno z: Medical Informatics in a United and Healthy Europe, K.P. Adlassnig et al. (Eds), IOS Press, 2009, 946-950, © 2009 European Federation for Medical Informatics.

Abstrakt

Příspěvek prezentuje analýzu toho, jak EFMI šíří nové znalosti a analýzu aktivních časopisů medicínské informatiky v členských zemích EFMI. Tato analýza byla výsledkem jednání Rady EFMI v Londýně v roce 2008. Analýza identifikuje osm hlavních aktivních informatických časopisů a několik dalších publikací. Většina z nich je založena na předplatném a vycházejí alespoň jednou za čtvrt roku. Existuje možnost, aby se editoři pravidelně scházeli a vytvořili praktickou společnost s cílem dále zlepšovat jejich účinnost v šíření nových znalostí a osvědčených postupů v oblasti medicínské informatiky. Je možné sdílet odborné znalosti a bylo by možné sladit několik aspektů příprav a podávání rukopisů a tím by byly sníženy některé ze zjištěných překážek v publikování.

Klíčová slova: EFMI, formulace hlavního cíle, pracovní skupina časopisů medicínské informatiky

 celý článek

 English

 Hrvatski

Abstrakt

Tento článek se zabývá automatickou lokalizací objektů (očí, úst) ve dvourozměrných (2D) černobílých obrazech obličejů. Je motivován praktickým problémem v genetice člověka a výstup lokalizace objektů v dané databázi obrazů je zapotřebí pro řešení dalších úloh v genetickém výzkumu. V článku se aplikuje robustní filtr na obrazy s cílem odstranit šum. Hlavní metodou jsou šablony. Ústa a obě oči se lokalizují současně za použití váženého Pearsonova korelačního koeficientu nebo jeho robustní analogie založené na robustních regresních metodách. V databázi s 212 obrazy obličejů tato metoda správně nalezne ústa a oči ve 100 % případů. Také robustní korelační koeficient založený na regresní metodě nejmenších vážených čtverců lokalizuje ústa a oči ve 100 % obrazů uvažované databáze. Článek studuje robustní aspekty této metody vzhledem k otočení, šumu, okluzi a asymetrii v obraze. Současná lokalizace úst i obou očí je invariantní vůči libovolnému otočení obličeje. Tato studie využívá speciální vlastnosti daných obrazů obličejů vzhledem k očekávanému použití v genetických aplikacích.

Klíčová slova: lokalizace objektů, šablony, detekce oči a úst, robustní korelační analýza, redukce šumu

 celý článek

 English

Spolehlivost, neboli reliabilita měření je mírou jeho opakovatelnosti za stejných podmínek. Klasický koncept reliability předpokládá, že se měření Y skládá ze skutečné hodnoty měřené vlastnosti T a chybové složky ε, dvou nezávislých náhodných veličin, Y = T + ε. Spolehlivost měření je pak definovaná jako podíl rozptylu skutečného skóru a rozptylu měření. Tento koncept nicméně není použitelný v modelech pro dichotomní měření, ve kterých nefigurují chybové složky, leč jsou definovány pomocí podmíněných pravděpodobností. V tomto článku zkoumáme obecnější definici spolehlivosti navrženou v [1], která je založena na rozkladu rozptylu v modelu se smíšenými efekty. Navržená definice splývá v klasické testové situaci s definicí klasickou, a navíc je použitelná také pro modely dichotomních měření. Nově jsou pro navrženou definici odvozeny předpoklady, za jejichž platnosti může být spolehlivost složeného měření vyjádřena pomocí spolehlivostí jediného měření (tzv. Spearmanova-Brownova formule) a je ukázána přibližná platnost Spearmanovy-Brownovy formule pro Raschův model. Na závěr zkoumáme tzv. logistické alfa – nový odhad spolehlivosti navržený v [2] coby modifikace klasického odhadu spolehlivosti založeném na Cronbachovu alfa. Simulace ukazují, že nový odhad nepodhodnocuje skutečnou spolehlivost tak často, jako Cronbachovo alfa. Logistické alfa se tak pro některé případy jeví být vhodnějším odhadem spolehlivosti. Nový odhad je použit na binární data získaná automatizovaným procesem diagnostiky prokrvení myokardu založeným na snímcích emisní protonové tomografie (SPECT).

Klíčová slova: spolehlivost měření, binární data, logistická regrese, Cronbachovo alfa, Raschův model, hodnocení perfuse myokardu

 celý článek

 English