EUROPEAN JOURNAL FOR BIOMEDICAL INFORMATICS   in English in English |  Česky Česky 
     
 
 

Přehled článků


 Electronic Health Record

Jivka Vinarova1, N. Tzacheva1

1. New Bulgarian University
24.11.2005
The article is devoted to the real working ELECTRONIC HEALTH RECORD (EHR) for the purposes of Bulgarian Occupational Health Services. This product was ordered by the Private Health - insurance Company, which maintains Occupational Health Services (OHSs) for insured persons. The functions, described in this Ordinance, are used in the elaborated Medical Information System (MIS). Below we introduce
  • Main screen for work, structured by activity types : for patients - in the left and for experts, working in Occupational Health Services (OHSs) - in the right area;
  • Passport – professional data screen – constant administrative-passport data and professional characteristics;
  • “Health Condition” screen - current health and medical information;
  • Information inquire and health indicators;
There is also a screen for Work of OHS specialists and their connection with GP. Every entry is connected with the system date, administrative-passport data of an employee and the system identifier. Information is a very expensive product, which serves for financial reports and analyses at the Health Insurance Fund . It’s used by many users in a dialog regime.

Keywords: Electronic Patient Record (EPR), Occupational Health Services, Medical Information System (MIS), OHS specialists



English celý článek
български български



 A Distributed Database System for Glaucoma Monitoring

Mihai L. Mocanu1,  Mihai Dorobanţu1,2, Carmen Mocanu3, Dumitru Burdescu1

1. Faculty of Automatics, Computers and Electronics, Software Engineering Department, University of Craiova,  2. Health Information Systems Enterprise Architecture Division, Imaging Science and Information Systems, Georgetown University,  3. Dept. and Clinic of Ophthalmology, University of Medicine and Pharmacy Craiova
24.11.2005

This paper describes, from a practitioner’s point of view, the concepts, methods and tools involved in the design of a practical and potentially low cost distributed information system, with web-based capabilities, for monitoring glaucoma.

Our experience with existing Hospital Information Systems (HISs) found them unsuitable in the very important monitoring process of patients with glaucoma. Actual Electronic Patient Record (EPR) schemes are more to do with management and appointment simple aspects than with clinical and decision-making processes. In a closer relationship to the specific of the affection, we found that demographic patient databases, usually known as Patient Administration Systems (PASs), have not been designed for being shared or concurrently exploited by different programs or even several replicas of the same program.

Many of the early deficiencies in the process of following-up glaucoma patients by dozens of different ophthalmologists in many independent offices from different clinics (with heterogeneous information recording, not very well managed by the existing office capabilities) could only be solved by specifying, designing and implementing a new EPR scheme in a mixed distributed environment, based on a distributed database as a demographic core (or PAS) of patients with glaucoma. A specialized health record management system, with core functionality in monitoring glaucoma, and core data organized as a distributed database system, has been designed in a bottom-up manner to meet the immediate needs. Its pilot implementation was intentionally kept flexible, taking in account developing standards, to accommodate any anticipated future requirements. Among many other benefits, the new EPR allowed medical doctors (ophthalmologists) to view and modify patient information and records in a safe, flexible and efficient manner. Improvements in all the managerial and decisional aspects (regarding costs and time delays) could also be remarked rapidly.

Keywords: medical databases, Electronic Patient Record (EPR), glaucoma management



English celý článek
Român Român



 Updating the BIOINFOMED Study: Recent Outstanding Developments in Biomedical Informatics

Fernando Martin-Sanchez1, I. Hermosilla1, F. J. Vicente1

1. Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, España
24.11.2005
In December 2001, the European Commission promoted a Conference in which more than 400 experts analyzed the synergies arisen between Bioinformatics (BI), Medical Informatics (MI) and Neuroinformatics. In November 2002, and in order to contribute to the strategy of the European R&D policy for the following decade in such areas, the White Paper of the BIOINFOMED project was presented at the international congress BIOINFORSALUD 2002 (Valencia, Spain). In the strategic document entrusted by the Commission, the relations established between BI and MI were analyzed, resulting in a new definition of the discipline of Biomedical Informatics (BMI) that aims to facilitate the developments of Genomic Medicine. To elaborate the White Paper, a committee of 30 international experts coordinated by the Institute of Health "Carlos III" (ISCIII) designed the agenda with 18 lines of research that corroborated the existing synergy. They pointed out those areas in which the efforts had to be prioritized. In this article, we update this study by highlighting recent outstanding developments in this field. The projects presented respond to a careful selection carried out among the numerous initiatives that have arisen in the three years passed between the publication of the White Paper and this article. Some of the projects analyzed in this paper are: the IT infrastructure for biobanks under the Public Population Project in Genomics (P3G) Consortium, a Network of Excellence (INFOBIOMED) in Biomedical Informatics constituted within the European Union Sixth Framework Program for Research and Technological Development, the initiative headed by HL7 to include genetic information in the electronic health record, the proposal of a Human Phenome Project, a Spanish Cooperative Research Thematic Network (INBIOMED) in Biomedical Informatics, the new National Centers for Biomedical Computing (NCBCs), funded by NIH, under the BISTI initiative and the projects related with the simulation and modeling of Human Physiology.

Keywords: Biomedical Informatics, Bioinformatics, Medical Informatics, Neuroinformatics



English celý článek
Español Español



 Distance Learning at the Medical Faculty of University of Sarajevo

Izet Masic1, Ahmed Novo1, Zlatan Masic1

1. Faculty of Medicine, University of Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
24.11.2005

Possibilities of introduction of distance learning in medical curriculum are the title of project which has been realizing at Department of Medical Informatics, Medical Faculty since year 2002. The Project is approved by Federal and Cantonal ministries of science and education. The purpose of this project is to support improvement educational process at biomedical faculties using contemporary methods, methodologies and information technologies in accordance with strategy and objectives given by Bologna declaration. The pilot project is realized during three years, the theoretical and practical parts of the subject Medical Informatics are adapted to modern concepts of education using world trends of distance learning. One group of students from the Medical Faculty was involved in this project, which was finalized by electronic registration of an exam and electronic testing on 20 June 2005, in public in the Physiological amphitheatre of the Medical faculty in Sarajevo. In this article we have given description of the project and phases of its realization, and basic adventages and disadvantages we have noticed so far.

Keywords: distance learning, biomedicine, medical curriculum



English celý článek
Na bosanskom Na bosanskom



 A New Web, Multi-service Tool for Regional Management of Allergies, Asthma and Rhinitis

Lamprini Kolovou1, C. Chassomeris1, G. Stalidis2, D. Lymperopoulos1

1. Wire Communication Lab, University of Patras,  2. Pouliadis Associates Corporation, Thessaloniki, Greece
24.11.2005

In this paper, a new web solution for administering allergies, asthma and rhinitis in a pan-European level is described. The proposed system was designed to provide: professionals with easy workload and access educational and informational material; sufferers with personalised management tools and educational sources; and citizens with rich informational material. The IREMMA system architecture embeds the existing information networks and data sources on allergy by offering high data integration and multi-modal access to its users, through a multi-service tool and high-distributed architecture. Hence, IREMMA sets the ground for establishing a wide integrated network for environmental monitoring and diffusion of health information. User feedback was collected through extensive pilot trials with real users and the results were used to improve the IREMMA services and the designing and the content specification.

Keywords: telematic services, allergies, environmental monitoring, web applications



English celý článek
Greek Greek



 Formalizace lékařských doporučení

Jan Peleška1, Zdeněk Anger2, David Buchtela1, Karel Šebesta3, Marie Tomečková1, Arnošt Veselý1, Karel Zvára3, Jana Zvárová1

1.  Department of Medical Informatics, Institute of Computer Science AS CR, Prague, Czech Republic,  2. 2nd Dept.of Medicine, General University Hospital,  3. EuroMISE s.r.o.
24.11.2005

Formalizace lékařských doporučení pomocí obecného grafického GLIF modelu je prezentována na formalizovaných Evropských doporučeních pro prevenci kardiovaskulárních chorob v klinické praxi z roku 2003 a Evropských (ESH/ESC) hypertenzních doporučeních z roku 2003 (HLD). Model vede uživatele rozhodovacími algoritmy pro diagnostiku několika chorob, stanovení celkového kardiovaskulárního rizika a výběr příslušné léčby. Navíc může ukázat jak základní informaci, tak příslušnou část kompletního textu lékařských doporučení (LD), která se týká vybraného elementu GLIF modelu. Formalizace LD lze použít jako zpětné vazby pro autory k odstranění nejasností a informačních nekonzistencí LD. Stanovení celkového kardiovaskulárního rizika a výběr lékové třídy je snažší ve srovnání s časově náročnou manipulací s tabulkami papírových LD. Lékářům nabízí systém pro podporu rozhodování a kontroluje jejich rozhodovací algoritmy ve srovnání s algoritmy LD. V budoucnosti by mohl sloužit jako nástroj pro audit práce lékařů jejich odbornou společností především jako automatický systém s přímou extrakcí dat ze strukturovaného zdravotního záznamu. Počítačová prezentace LD má potenciál pro snažší implementaci znalostí LD než klasická papírová forma LD, a může tak zlepšit primární péči u kardiovaskulárních chorob.

Klíčová slova: GLIF model, formalizace lékařských doporučení, prevence kardiovaskulárních chorob



Česky celý článek



 Předpověď průtoku krve bypassem pomocí statistických metod

Jana Vrbková1, Vilém Bruk2

1. Department of Mathematical Analysis and Applications of Mathematics, Faculty of Natural Sciences, Palacky University Olomouc, Czech Republic,  2. Clinic of Cardiosurgery, Faculty Hospital Olomouc, Czech Republic
15.08.2006

Revaskulatizace myokardu patří mezi nejčastější kardiochirurgické zákroky. Perioperační i dlouhodobá úspěšnost revaskularizace koronárního řečiště závisí na průchodnosti použitého štěpu a kvalitě anastomózy. Hemodynamické charakteristiky měřené peroperačně pomáhají ověřit kvalitu anastomózy a ovlivňují i dlouhodobou průchodnost použitého štěpu. Při operacích bypassu v mimotělním oběhu chirurg měří průtok krve štěpem v době, kdy je na aortě naložená svorka (do srdce nepřichází krev prostřednictvím koronárních cév, ale pouze měřeným štěpem), a později měří na tomtéž místě průtok po povolení svorky na aortě. Cílem této práce je nalézt model s jehož pomocí bude možné předpovědět průtok krve štěpem po povolení svorky na aortě na základě prvního měření při naložené svorce. Při spolehlivé predikci by bylo možné snížit počet měření se současným zachováním informace o objektu.

Klíčová slova: revaskularizace myokardu, predikce průtoku a tlaku krve, vícerozměrná lineární regrese, nelineární regresní model, linearizace, lineární regresní model s podmínkami, outlier, leverage

Česky celý článek




 Metody strojového učení pro vyhledávání znalostí v lékařských datech o ateroskleróze

José Ignacio Serrano1, Marie Tomečková2, Jana Zvárová2

1. Instituto de Automática Industrial, CSIC, Madrid, Spain,  2.  Department of Medical Informatics, Institute of Computer Science AS CR, Prague, Czech Republic
15.08.2006

Techniky strojového učení jsou metody, které umožní vytvořit z trénovací množiny případů model pro kategorie dat tak, že mohou být nové (neznámé) případy zařazeny do jedné nebo více kategorií schématem odpovídajícím modelu. Pro tento typ analýzy jsou velmi vhodná data ze studií sledujících určitou skupinu osob s opakovaným sběrem dat stejného typu. K vyhledávání znalostí z medicínských dat bylo užito různých algoritmů strojového učení. Bylo testováno několik algoritmů tak, aby bylo možno pokrýt většinu způsobů učení s učitelem. Byly provedeny dva typy pokusů. Jeden hledal vztahy mezi atributy, druhý testoval predikci budoucích příhod. Pro pokusy v tomto sdělení byla užita data z dvacet let trvající longitudinální primárně preventivní studie rizikových faktorů (RF) aterosklerózy u mužů středního věku. Studie se nazývá STULONG (LONGitudinal STUdy). Výsledky ukazují, že některé metody předpovídají některé poruchy lépe než jiné a že je tedy vhodné použít všechny algoritmy najednou a posuzovat spolehlivost výsledku na základě známého trendu každé metody. Algoritmy strojového učení byly také použity k předpovědi příčiny úmrtí. V tomto případě byly výsledky nevalné, pravděpodobně pro malé množství informace ve vstupních položkách v datového souboru.

Klíčová slova: dobývání znalostí, strojové učení s učitelem, vytěžování z biomedicínských dat, rizikové faktory aterosklerózy



Česky celý článek
Español Español



 Málorozměrná multimodální pružná registrace obrazů mozku z MRI ve stereotaktickém prostoru

Daniel Schwarz1, Ivo Provazník2

1. Institute of Biostatistics and Analyses, Masaryk University, Czech Republic,  2. Department of Biomedical Engineering, Brno University of Technology, Czech Republic
15.08.2006

Pružná registrace obrazů je klíčovou technikou ve výpočetní neuroanatomii. V tomto článku je navržena registrace metodou iterativního lícování podobrazů s několika vylepšeními z oblastí mnohorozměrné multimodální registrace a registrace založené na význačných bodech. Je zde použita symetrická multimodální podobnostní metrika, díky které je možno registrovat obrazy různých subjektů na libovolný digitální atlas mozku. Výsledné deformace jsou získány pomocí interpolační techniky založené na radiálních bázových funkcích. Deformace potlačují v obrazech pouze hrubé tvarové rozdíly mezi různými subjekty a ponechávají v nich jemnou anatomickou variabilitu, která bývá předmětem následného zkoumání vybranými morfometrickými metodami. Součástí příspěvku jsou kvantitativní výsledky z experimentálního ověření navržené metody se čtyřmi různými podobnostními metrikami na obrazových datech ze simulátoru obrazů mozku.

Klíčová slova: zpracování obrazů, registrace obrazů, MRI, výpočetní neuroanatomie, radiální bázové funkce



Česky celý článek



 Information and Communication Technology in Family Practice in Croatia

Josipa Kern1, Ozren Polašek1

1. Andrija Stampar School of Public Health, Zagreb University Medical School, Croatia
01.11.2007

Family practice was the first privatized part of the health care system in Croatia. Recently, 84 % of family practices are privatized. Other 16% of them left within health centers. In order to assess current status of use of the information and communication technology (ICT) in family practice, physicians specializing in the family medicine, being also the postgraduate students of the University of Zagreb, School of Medicine in the year 2004/05, have been surveyed. The sample consisted of 159 physicians. Some kind of information system (IS) exists in 62 % of family practices under lease, 42 % within health centers, and 91 % of completely private offices. Having IS in their offices, physicians use it primarily for administration: reporting, prescriptions, sick leaves, referrals and for billing. Usage of ICT in medical work, electronic medical records, was found at about 50 % of physicians. Doing research based on information stored in e-format, is conducting by 31 % of physicians. Based on e-information 35 % of physicians evaluate their work. About using e-sources of medical knowledge (bibliographic data bases, e-journals): 86 % physicians from private offices, 79% physicians working within health centers, 60 % physicians from offices under lease. Satisfaction with current information system is small (19 %). Their information needs are covered partially. 32 % of physicians said they can get enough information by using their information system. 40 % of physicians feel that ICT gave more efficiency to their work, and 25 % of physicians feel their patients are more satisfied since the IS was put into function. Considering different types of practices – young physicians working in health centers are less satisfied with their ISs than the other two groups of physicians coming from private practice. Data security was practiced by using a password, physical protection, and by daily archiving of data .

Keywords: information system, family practice, electronic medical record, Internet, computer security, bibliographic databases, consumer satisfaction



English celý článek
Hrvatski Hrvatski



 Classification of Body Surface Potential Maps: A Comparison of Isointegral Measurements in the Diagnosis of Old Myocardial Infarction

Dewar D. Finlay1, Chris D. Nugent1, Haiying Wang1, Huiru Zheng1, Mark P. Donnelly1, Paul J. McCullagh1

1. University of Ulster, School of Computing & Mathematics, Northern Ireland, UK
01.11.2007

The electrocardiogram (ECG) is one of the most common ways to record, in an non-invasive manner, a patient’s cardiac activity. Once recorded the information can be pre-processed and subsequently analyzed to assess if the patient is suffering from any forms of cardiac abnormality which may require clinical intervention. In the current study we investigate ways in which more can be obtained from the ECG through analysis of the diagnostic properties of body surface potential maps (BSPM). A set of 192 lead BSPMs recorded from a mixture of 116 normal and abnormal subjects (59 normal vs 57 old myocardial infarction) were analyzed. For each patient, diagnostic features were obtained by calculating isointegral measurements from the QRS, STT, and entire QRST segments. These isointegrals provide a measure of the mean distribution of potential during ventricular depolarization, repolarisation, and a combination of both, respectively. For each isointegral type, 192 discrete measurements, and hence 192 features, were obtained; these correspond with the 192 leads recorded. Subsequent to this a signal-to-noise ratio-based feature ranking methodology was applied to select subsets of the best three, six and ten measurements (features) from the 192 available for each isointegral. These subsets of features were then applied to four different classifiers Naïve Bayes (NB), support vector machine (SVM), multi-layer perceptron (MLP) and random forest (RF) and in each application ten-fold cross validation was employed. It was found that when using the subsets of features obtained from the STT or QRST isointegrals, classification results in excess of 80% were attainable. This was in contrast to the results obtained using the QRS isointegral features where poorer performance (between 62.9% and 74.1%) was observed. The results from this study have illustrated that, for the studied dataset, the mean distribution of potentials during ventricular depolarization, and during ventricular repolarization and depolarization combined possessed greater diagnostic information. Overall it was concluded that this approach to BSPM analysis does provide a useful means for illustrating the usefulness of various features in diagnostic classification.

Key words: electrocardiogram, body surface potential map, myocardial infarction, feature selection



English celý článek



 Ranked Modeling of Liver Diseases Sequence

Leon Bobrowski1,2, Tomasz Łukaszuk1, Hanna Wasyluk3

1. Białystok Technical University, Faculty of Computer Science, Poland,  2. Institute of  Biocybernetics and Biomedical Engineering, PAS, Warsaw, Poland,  3. Medical Center of Postgraduate Education, Warsaw, Poland
01.11.2007

Ranked model in the form of linear transformation of multivariate feature vectors on a line can reflect a causal order between liver diseases. A priori medical knowledge about order between liver diseases and clinical data sets has been used in the definition of the convex and piecewise linear (CPL) criterion function. The linear ranked transformations have been designed here through minimization of such CPL criterion functions.

Keywords: sequential patterns, ranked linear transformations, convex and piecewise linear (CPL) criterion functions, linear separability of data sets, sequence of liver diseases



English celý článek
Polski Polski



 The Use of Object-Oriented Technologies for Medical Data Storing and Retrieving

Vita Speckauskiene1, Arunas Lukosevicius1

1. Biomedical Engineering Institute at Kaunas University of Technology, Lithuania
22.12.2008

The article focuses on object oriented technologies and the usage of these technologies, how to create an information system (IS) for applications in medicine, specifically in ophthalmology. The rapid evolution of medical data standards, concepts and technologies has created a problem – how to develop a system that would be flexible enough to work with evolving data. After the analysis of object-oriented technologies: Java 2 Platform, Enterprise Edition (J2EE) and Microsoft .NET and open source object-oriented data base management systems (OODBMS) we have proposed and created a system based on .NET and OODBMS db4o. Results include the developed system with proposed architecture and used techniques, also the advantages of object-oriented data bases (OODB), the systems’ possible interoperability with the National Electronic Health Record system. Developed IS should help medical specialists to reach important information from any computer in any hospital.

Keywords: object-oriented technology, object-oriented data base, information system, data storing standards



English celý článek
Lithuanian Lithuanian



 Konturový vlnkový detektor pro analýzu arytmií

Dina Kičmerová1, Ivo Provazník1

1. Department of Biomedical Engineering, Brno University of Technology, Czech Republic
22.12.2008

Článek se věnuje návrhu automatického detektoru vybraných arytmií. Navržený algoritmus využívá spojitou vlnkovou transformaci (CWT) v kombinaci s analýzou její konturové obálky. Vlnková transformace byla využita v detektoru R vln, k rozlišení normálních a abnormálních stahů a pro detekci předčasných atriálních kontrakcí (APC) a předčasných komorových kontrakcí (PVC). Algoritmus byl ověřen rozsáhlým testováním na MIT/BIH databázi. Hledáním lokálních maxim ve vlnkové konturové obálce jsou účinně detekovány R vlny. Celková úspěšnost detekce testovaná na 48 půlhodinových signálech je 99,5 %. Byly otestovány dva typy klasifikace: 1. klasifikace založená na konturové obálce a detekci význačných bodů s celkovou úspěšností 94,6 %, 96,1 % pro sinusový rytmus (SR), 30,4 % pro APC, 71,2 % pro PVC a 2. lokalizace maxima umocněných koeficientů spojité vlnkové transformace v oblasti QRS komplexu k určení PVC mezi SR, blokádou pravého Tawarova raménka (RBBB), APC a dalšími arytmiemi s úzkým QRS komplexem s přesností 96,8 %.

Klíčová slova: arytmie, EKG signál, vlnková transformace, kontury



Česky celý článek



 Ischemická choroba srdeční u mužů v České republice, 1980-2004

Jindra Reissigová1, Marie Tomečková1

1. Centre of Biomedical Informatics, Institute of Computer Science AS CR, Prague, Czech Republic
22.12.2008

Pozadí: Česká republika patří mezi země s vysokou úmrtnostní na ischemickou chorobu srdeční (ICHS). Cílem bylo analyzovat specifickou úmrtnost na ICHS podle věku, období a kohorty narození u mužů v České republice.

Design a metody: Analyzovala se národní data úmrtnosti mužů (30-74 let) v České republice v letech 1980-2004. K hodnocení vlivu věku, období a kohorty na úmrtnost se použil Poissonův regresní model.

Výsledky: Úmrtnost na ICHS u mužů adekvátně popisoval model zahrnující věk, období a kohortu (p=0,121). Poměr úmrtností věkových skupin 45-49 k 40-44 byl o 17 % nižší než odpovídající poměr věkových skupin 40-44 k 35-39. Poměr relativních rizik v obdobích 1995-1999 k 1990-1994 byl o 19 % nižší než odpovídající poměr v obdobích 1990-1994 k 1985-1989. Poměry relativních rizik mezi sousedícími kohortami kolísaly kolem hodnoty 1.

Závěry: Riziko úmrtnosti na ICHS bylo u mužů v České republice významně závislé na věku (riziko se zvyšovalo s věkem), kalendářním období (riziko se snížilo v posledních letech) a kohortě narození (riziko se snižovalo s kohortou narození). Zásadní pozitivní změna ve vývoji úmrtnosti na ICHS nastala po pádu komunismu v roce 1989 a u mužů po 40. roce věku.

Klíčová slova: ischemická choroba srdeční, kardiovaskulární, úmrtnost, riziko



Česky celý článek



 Model reprezentace znalostí v doporučeních

David Buchtela1, Jan Peleška1, Arnošt Veselý1, Jana Zvárová1, Miroslav Zvolský1

1. Centre of Biomedical Informatics, Institute of Computer Science AS CR, Prague, Czech Republic
22.12.2008

Model reprezentace znalostí obsažených v lékařských doporučeních GLIKREM (GuideLInes Knowledge REpresentation Model) vychází z GLIF modelu, který byl publikován ve specifikaci GLIF3.5. GLIKREM obsahuje některé změny a rozšíření definice a implementace původního GLIF modelu. Cílem tohoto příspěvku je popis znalostního modelu GLIKREM, jeho konstrukce, implementace v XML, realizace datového rozhraní a použití výsledného modelu.

Klíčová slova: reprezentace znalostí, GLIF model, doporučení



Česky celý článek



 
PDF versions:
2005   2006   2007-1
 
Published by EuroMISE s.r.o.